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      南极磷虾的食道呈绿色，主要是以浮游植物为食，尤其是细小的硅藻（约 20um）。硅藻会被它的胃齿臼磨碎，并在肝胰脏消化。南极磷虾亦可以捕食桡 足亚纲、端足目及其他细小的浮游动物。它的食道是一直管，消化效能不高，因 而其粪便含有大量的碳。
   
      主要的植物性浮游生物包括矽藻、褐藻、双鞭藻等，统称为冰藻，其中南极 矽藻（Fragilariopsis antarctica）为其主食。南极海域的食物链非常简单：植物性 浮游生物→南极磷虾→须鲸，可以说是世界上最短的食物链。在水族箱中，南极磷虾会互吃对方。
   
      当食物缺乏时，它们会脱壳缩小体型， 这是其他动物所没有的，可能是它们对冬天食物供应限制的适应。因此，无法根据南极磷虾体型的大小来判断其年龄。